Instruments

Extraction d’ADN/ARN

La plateforme mets à disposition un robot d’extraction King Fisher Flex avec une tête aimantée 96 puits. Une grande gamme de kit d’extraction avec billes magnétique est compatible avec le robot. Après formation, les utilisateurs peuvent utiliser le robot en accès libre après réservation sur notre GRR. Chaque utilisateur vient avec son kit d’extraction & l’ensemble des plastiques nécessaires est fourni par la plateforme.

 

En complément une thermomixeur Eppendorf avec adaptateur plaque 96, tubes 0.5ml ou tube 1.5ml est disponible, ainsi qu’une scelleuse de plaque.

Dosage d’acides nucléiques

La concentration et la pureté des solution d’acide nucléique peut être estimé à la plateforme avec un Qubit monocanal ou un Qubit Flex avec 8 canaux. La plateforme fournis l’ensemble des consommables nécessaires au dosage Qubit (ie plastique et kit de dosage). Les kit ADN BR, ADN HS, ADNss, ARN et protéine sont disponibles à la plateforme.

Un Nanodrop 8000 à 8 canaux est également mis gratuitement à disposition. Un fiche projet reste nécessaire pour avec accès au Nanodrop.

Les deux appareil sont réservable sur notre GRR.

   

  

 

Vérification de la taille de fragments d’acides nucléiques

Nous avons deux électrophorèse capillaire qui permettent de vérifier la taille de fragment d’ADN ou ARN:

• Le fragment analyzer: pour la vérification de banques (fragments inférieur à 40kb)
• Le Femto: pour les analyses d’ADN génomiques (fragments entre 10kb et 200kb)

Ces machines sont exclusivement opérées par le personnel de la plateforme. Les réservation se font par mail: genseq-contact@umontpellier.fr.

Automates pipeteurs

Nous disposons de deux automates pipeteurs. Un préPCR et un postPCR. Ils peuvent être utilisé pour automatiser: les construction de banques, les purifications, la constitution de pool et les normalisation de solution d’acides nucléiques.

 

 

 

 

Sonication

Un sonicateur de type Covaris S220 est à disposition des utilisateurs après formation.

Séquençage

Nous avons sur la plateforme un séquenceur MiSeq (Illumina) pour le séquençage de short-reads. Selon les cartouche de séquençage le débit par run varie entre 0.3 et 15Gb, pour des tailles de reads allant de 150 à 600pb.