Électrophorèse capillaire

• Séquenceur 24 capillaires ABI3500XL.

 

• Poste d’analyse avec les logiciels GeneMapper 5, Seqscape 3.

 

 

 

GenSeq réalise les électrophorèses capillaires d’échantillons préparés par les utilisateurs dans leurs propres laboratoires.

Pour l’analyse de fragments tels que les microsatellites deux matrices ont été installées, elles correspondent aux combinaisons de fluorochromes suivantes :

Dye Set	Filter	Blue	Green	Yellow	Red	Orange
DS-30	D	6-FAMTM	HEXTM	NEDTM	ROXTM	–
DS-33	G5	6-FAMTM	VIC®	NEDTM	PET®	LIZ®

L’analyse des séquences est calibrée pour du BigDye version 3.

Le passage des échantillons est géré sur la base d’un planning hebdomadaire établi en fonction des demandes d’analyses.

Demandes d’analyses par messagerie à faire parvenir le vendredi pour passage la semaine suivante.

Genseq propose également la réalisation de réactions de séquençage classique (protocole Sanger) suivi d’électrophorèse capillaire. Ce service fait l’objet de demandes particulières et nécessite de compléter le formulaire « Demande-Service-Sequencage » communiqué après réception de la fiche d’accueil de projet.

Fragment Analyzer

Electrophorèse capillaire en gel non-dénaturant pour l’analyse qualitative ou quantitative d’ADN ou ARN

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